Die äußerst beliebte und sehr häufig gespielte Triosonate BWV 1039, die Bach auch für Gambe und Cembalo bearbeitet hat, ist neben jener aus dem Musikalischen Opfer und den Triosonaten für Orgel die einzige Triosonate, deren Echtheit völlig zweifelsfrei gesichert ist. Für eine alternative Ausführung mit zwei Violinen hat der Herausgeber die gesicherten Varianten im Kleinstich angegeben.